南京信息工程大学生态学专业设立于2001年，2005年获批生态学硕士学位授予权（二级学科），2011年获批生态学一级学科硕士学位授权，2018年获批环境生态学博士点（二级学科）。本专业目前拥有中央与地方共建的“生态过程及其环境响应实验室”、“生态气象环境研究中心”、教育部科技创新团队、江苏省特色专业建设点、江苏省重点实验室等学科平台。依托传统的生态学科方向，围绕区域特点与气象特色，重点发展具有区域特点及气象特色的生态学学科体系，为我国（特别是长三角地区）培养全面发展的生态学高层次专门人才，以满足区域生态文明建设的战略需求。